奖惩制度管理是高职院校二级学院学生管理的重要手段。学院应建立健全奖惩制度，明确奖励和惩罚的种类、范围和实施方式。对于表现优秀的学生，要给予适当的奖励和荣誉，激励他们继续发挥优势；对于违纪违规的学生，要按照制度进行严肃处理，以维护校园秩序和公平正义。同时，建立健全的奖学金制度，鼓励学生学习进步和全面发展。